Os parafusos da placa-mãe geralmente estão sendo parafusados nos espaçadores que, por sua vez, são parafusados no gabinete:
O parafuso do gabinete tem uma linha diferente da da placa-mãe, então, ao parafusá-lo no espaçador, você basicamente removeu a linha.
Então para tirá-lo você precisa chegar ao espaçador e segurá-lo (talvez com uma chave inglesa do tamanho pequeno) enquanto tenta desparafusá-lo.
A outra opção é remover TODOS os parafusos exceto o seu e tentar remover a placa com o espaçador ainda preso e remover se depois