Se você iniciar o instalador, muitas vezes verá o branding para o empacotador se a maioria deles ... Por exemplo, o Installshield sempre marca o instalador.
Outros, você pode clicar com o botão direito e extrair (eu gosto de 7zip) e ver o que é descartado, às vezes você verá um MSI ou outra informação boa.
Você também pode usar o prompt de comando para obter opções e, às vezes, isso informará. Se você executar myInstall.exe /? e os comutadores MSI aparecem, então é um MSI.
Não há concreto, sempre diz exatamente a você, qual construtor de pacotes foi usado até onde eu saiba,