Estou assumindo que você está usando o PuTTY para se conectar ao seu servidor Linux via SSH? Nem o PuTTY nem a linha de comando do Windows podem fazer transferências de arquivos diretamente sem alguma coisa adicional em primeiro lugar. Depende se você quiser usar o PuTTY / Windows CMD para baixar (extrair) o arquivo do seu servidor Linux, ou se você quiser usar um terminal no seu servidor Linux para carregar (enviar) o arquivo para o seu cliente Windows.
Se você está puxando / baixando do lado do cliente do Windows:
- Use o PSCP.EXE do PuTTY para abrir um SCP (protocolo de cópia segura) em seu servidor Linux. Isso pode fazer upload / download de arquivos em uma linha de comando em execução no seu cliente Windows. PSCP.EXE pode ser baixado aqui: link
Eu recomendaria isso, já que você não precisará de nenhum software adicional instalado. - Use o cliente FTP do Windows (FTP.EXE) para carregar / baixar arquivos no prompt de comando nativo do Windows. Isso exigirá que um servidor FTP seja instalado em seu servidor Linux, como vsftpd ou proftpd. Um guia decente para o FTP do Windows está aqui: link
Se você está empurrando / enviando do lado do servidor Linux:
- Você terá que instalar um servidor FTP em sua máquina Windows para receber um arquivo de um cliente FTP do Linux, como o FileZila Server. Você pode usar o comando FTP do Linux para se conectar ao seu cliente Windows e enviar o arquivo para ele: link
Eu recomendaria essa opção menos que tudo.