Eu tive o mesmo problema em um ambiente muito similar (rodando o Juju e o MAAS no VSphere). Primeiro, também achei que o problema era o MongoDB, então atualizei a versão no nó de bootstrap. Mas o que resolveu o problema é ter as configurações de DNS corretas no nó em que você está executando o juju-core porque ele está usando FQDNs ao se conectar a nós. Portanto, verifique se é possível efetuar ping no nó de inicialização usando o FQDN.