O NTFS faz distinção entre maiúsculas e minúsculas (consulte aqui ) dependendo do namespace em que está sendo executado. Em um ambiente Win32, ele não diferencia maiúsculas de minúsculas, em outros ambientes POSIX, ele diferencia maiúsculas de minúsculas. Em essência, é muito mais sobre o sistema operacional do que o sistema de arquivos (FS).
De um modo geral, porém, isso significa apenas que o sistema operacional tem a opção de tratar algo como insensível a maiúsculas e minúsculas (ele poderia fazer uma comparação insensível por conta própria).Não há mudança que você irá alterar o sistema de arquivos desta forma para torná-lo insensível a maiúsculas e minúsculas. Seria:
- exigem WAY para codificação de muito baixo nível
- impactam todos os sistemas operacionais que precisariam ser executados no FS
Se você estiver procurando por algo mais específico (digamos, converter todos os nomes de arquivos para minúsculas na unidade), pode haver algo que pode ser feito, mas o próprio sistema de arquivos permanecerá inalterado.