Para a configuração mais simples, o instalador da nova distro deve reconhecer os dois sistemas operacionais instalados curretly e não interferir com eles (instale-se em uma nova partição, adicione-se à configuração existente do Grub).
Se você deseja mais conveniência, sua configuração parece razoável: configure três partições, duas com pontos de montagem de / para cada sistema operacional e a terceira com um ponto de montagem de / home / usado por ambos. Você deve ser capaz de configurar isso razoavelmente facilmente com os instaladores de distribuição. Observe que o suporte ao Linux para NTFS agora é robusto, então talvez você queira montar a partição do Windows para a maioria do armazenamento de arquivos (uma configuração avançada faria com que todos os três sistemas operacionais colocassem seus perfis de usuário em uma partição NTFS - não particularmente fácil, mas factível) ).