Depende realmente do sistema e do chip usado no leitor de cartões.
O BIOS tem que suportar o dispositivo como um dispositivo inicializável e, muitos suportam apenas um número muito limitado de dispositivos.
Se você colocá-lo e ele estiver disponível como uma opção de dispositivo inicializável, você formatará o dispositivo com uma partição ativa e incluirá os arquivos de configuração - muito provavelmente você poderá.
Assim sendo, é muito melhor comprar um pendrive USB e instalá-lo, já que a maioria dos BIOS suporta a inicialização em massa.