Gravar como disco de dados trará arquivos FLV inalterados para o CD. Eu não sei se o seu DVD player pode reproduzir FLV, o meu não pode (embora seja um pouco antigo).
Outra opção seria gravar como Video DVD. Você pode usar, por exemplo, Nero Vision para criar um DVD de vídeo "real", ele deve converter os arquivos para o formato apropriado