Resposta curta. Não
O mecanismo do webkit ainda não tem uma maneira de lidar com o NTLM, e não há planos, tanto quanto eu estou ciente disso.
O SharePoint criou uma solução alternativa para isso na maneira de lidar com cookies no SP2 e, em 2010, por exemplo, para permitir que o servidor "pense" que o navegador é autenticado por NTLM.
Eu tenho investigado isso nos últimos 6 meses, temos mais de 150 usuários de Mac que precisam de acesso ao SharePoint, por exemplo, e o Safari é meu navegador pessoal favorito