Parece que você está interessado em copiar esses filmes ("ripar DVDs") para o seu computador e não transcodificar o vídeo como está fazendo atualmente. Como o @sawdust explicou, o Handbrake não copia 1: 1, mas é um transcodificador. Simplesmente rasgando sem transcodificação, você terminará de mover sua coleção mais rapidamente e preservará a qualidade de vídeo / áudio, menus de DVD, extras, etc. (se você preferir), à custa de precisar de mais espaço em disco. Existem programas como CloneDVD que podem ajudá-lo com isso.
Para responder à sua pergunta mais diretamente, copiar DVDs para o disco rígido é quase sempre limitado pela velocidade da unidade de DVD. No seu caso, no entanto, a adição de transcodificação pelo Handbrake muda essa questão para não apenas copiar, mas transcodificar. Nesse caso, muitos fatores adicionais, incluindo CPU, GPU, RAM podem ser a causa limitadora.
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Depois de entender um pouco melhor suas circunstâncias, eu diria que ripar cópias 1: 1 é provavelmente mais rápido do que transcodificação ("re-codificação") com o Handbrake pelas razões já apresentadas. Quanto mais rápido não posso dizer sem testar com sua máquina.