O mSATA e o mini-PCIe usam o mesmo conector físico.
Os sinais são diferentes, então o mSATA não funcionará em um slot mini-PCIe ou vice-versa. Alguns chipsets permitem que o firmware faça um slot funcionar como mini-PCIe ou mSATA.
Anúncios ou manuais podem dar errado e chamar de SSD mini-PCIe, então acho que o que você está procurando é um mau uso da terminologia.
Agora, uma citação de um fórum :
True mini PCIe ssd cards do exist, but are rare, have tiny capacities and command a hefty price. Finding the real McCoy is also exceedingly difficult since tons of sellers list mSATA cards as 'mPCIe'.
Eu nunca vi um SSD mini-PCIe real, mas supostamente eles existem. Eles provavelmente existiam na época em que os laptops vinham com slots "Cache Module" que precisavam de um módulo baseado em flash, mas não o expunham como um drive. SSDs mini-PCIe reais são raros o suficiente para que, se você encontrar o termo usado, possa seguramente assumir que é um erro.