O comando básico abaixo lhe dará uma baunilha MP4
ffmpeg -i in -c:v libx264 -profile:v main -pix_fmt yuv420p -c:a aac -ac 2 -movflags +faststart out.mp4
Eu teria omitido o perfil e a contagem forçada de canais estéreo ( -ac 2
) normalmente, mas para compatibilidade preventiva, eles são mais seguros.