Primeiro, não há SCCM 2016, uma nova filial do SCCM será lançada com o Windows Server 2016 ou o System Center 2016 Suite.
Como você disse, não há muito documento público para esse tópico, gostaria de compartilhar algo com você.
Na verdade, geralmente podemos considerar colocar o CAS no Azure, mas não a infra-estrutura central do SCCM. Mas tecnicamente você pode fazer isso
Você já pode instalar a ramificação atual do SCCM 1060 no Azure, incluindo o servidor do site primário, o banco de dados, o WSUS, o relatório, o App Cat, a AI etc.
Para gerenciar os dispositivos locais, é necessário configurar um DP e MP no site de suas instalações.
Você precisa configurar o Site para VPN do site entre sua rede do Azure e o site local.
Eu entendo que você só deseja gerenciar o dispositivo local, mas apenas deseja compartilhar com você, alguma necessidade de transmissão de recurso não funcionará para as VMs no Azure, como PXE, WDS ....
O Azure não suporta transmissão (cf. link ).
“O WDS não pode ser executado em uma máquina virtual no Windows Azure.”
link