Partições no esquema de particionamento tradicional (tabela MSDOS, não GPT) estão trabalhando com partições primárias e estendidas . Pode-se ter no máximo quatro partições primárias, ou três primárias e uma extensão na qual a partição estendida pode conter mais algumas (dentro dela).
O kernel representa todas as partições primárias como 1-4 e todas estendidas de 5 para cima. O sda2 que você está vendo é a partição "guarda-chuva" estendida, que contém apenas mais uma partição: sda5 . Esse esquema de numeração é exatamente como está sendo representado.
No seu caso com apenas duas partições reais, não teria sido necessário criar uma partição estendida, pois você não está atingindo o limite de partições primárias.