Você tem algumas escolhas:
echo "aqw" | gpg --batch --passphrase-fd 0 -d -o output.txt secret.txt.gpg
ou
gpg --batch --passphrase "aqw" -d -o output.txt secret.txt.gpg
ou
gpg --batch --passphrase-file passphrase.txt -d -o output.txt secret.txt.gpg
(se você não quiser escrever sua senha na linha de comando)