Tecnicamente não. É possível que um aplicativo seja executado sem um manipulador de janela, o que significa que ele não será exibido na guia do aplicativo, mas se você alternar para a guia Processos, você ainda o verá. Os gerenciadores de tarefas mais modernos, como o ProcessHacker2, mostram tudo, independentemente de quão bem alguém tenta escondê-lo.
A terceira opção é se um aplicativo é executado como serviço. Não aparece como processo, mas sim como serviço.