Não há como torná-los funcionais novamente; na verdade, é o próprio disco que detecta os setores defeituosos e os desativa. Há uma reserva de setores que não são usados quando o disco é novo e substitui setores que estão marcados como ruins. Não há necessidade de remover manualmente setores do uso.
Você costuma ter que marcar setores como ruins dentro do sistema de arquivos, mas a menos que este disco seja antigo (mais de 15 anos de idade) não é o caso para você.
Dito isto, discos com setores defeituosos geralmente estão indo mal e ganharão mais e mais setores ruins ao longo do tempo. Todo setor ruim é um dado perdido. Sugiro imediatamente fazer o backup de todos os dados e substituir o disco.