Suspeito que seja uma combinação de duas coisas:
Primeiro, a região azul na guia Partição do Utilitário de Disco não é apenas o espaço ocupado pelos arquivos, mas também inclui alguma sobrecarga de proteção que o Utilitário de Disco adiciona automaticamente. O Utilitário de Disco não permitirá que você diminua a partição até que não haja mais espaço, e a região azul leva isso em consideração.
Em segundo lugar, parte do espaço em disco pode ser ocupado por snapshots locais do Time Machine ; O Disk Utility e o Finder tratam o espaço que ocupam gratuitamente (porque ele será liberado sob demanda), mas está tecnicamente em uso, e tenho certeza que está incluído na região azul do Utilitário de Disco.
Se você quiser ver quanto espaço eles ocupam, use Informações do sistema (no menu Apple, escolha Sobre este Mac e, em seguida, clique em Mais informações . na aba Storage , então procure por uma seção roxa Backups no gráfico de uso).