Encontrei o problema que você teve e encontrei a solução.
Suas configurações pessoais de menu são armazenadas em:
~/.config/menus/xfce-applications.menu
e suas configurações pessoais do painel são armazenadas em:
~/.config/xfce4/xfconf/xfce-perchannel-xml/xfce4-panel.xml
E as configurações do sistema são armazenadas nos locais abaixo:
/etc/xdg/xdg-xubuntu/menus/xfce-applications.menu (menu)
/etc/xdg/xfce4/xfconf/xfce-perchannel-xml/xfce4-panel.xml (panel)
Então, se você quiser refletir sua personalização pessoal na configuração do sistema para remasterização, basta digitar esses dois comandos no terminal.
sudo cp ~/.config/menus/xfce-applications.menu /etc/xdg/xdg-xubuntu/menus/
sudo cp ~/.config/xfce4/xfconf/xfce-perchannel-xml/xfce4-panel.xml /etc/xdg/xfce4/xfconf/xfce-perchannel-xml/
No entanto, na sua configuração, isso deve remover o painel, mas não tenho certeza sobre o cairo-dock.
Espero que isso ajude em alguma medida.