Embora você possa fazer com que o sistema operacional use apenas um processador, não tenho certeza se isso resultará em uma enorme economia de energia. Você não menciona qual Core 2 específico você tem, mas a maioria das CPUs multi-core modernas são capazes de reduzir os núcleos que não são usados para gerenciamento de calor e energia.
Além disso, dependendo do que você está usando o laptop, você pode consumir mais energia. Isso ocorre porque (dependendo da carga de trabalho) um núcleo pode estar em execução por mais de dois núcleos. Veja esta revisão do relatório técnico para um exemplo de como isso pode funcionar.
Minha recomendação seria usar os dois núcleos e deixar a CPU gerenciar a energia.