Você pode criar um alias na sua configuração ssh. Por exemplo:
Host example.github.com
HostName github.com
IdentityFile ~/.ssh/id_rsa_example
Verifique se o seu git remote faz referência ao alias ssh "example.github.com". A diretiva "IdentityFile" deve apontar para o caminho onde você planeja armazenar sua chave privada. Isso diz ao ssh qual chave associar ao alias.