Não deve haver diferença significativa.
A única diferença seria que, em um sistema operacional de 64 bits, normalmente é reservado mais espaço de memória insuficiente para DMA (ou memória de dispositivo mapeada), o que pode melhorar um pouco o desempenho. A reserva de espaço com pouca memória é gratuita em um sistema operacional de 64 bits (já que acessar a memória mapeada em endereços acima de 4 GB não é mais difícil do que endereçar a memória mapeada como inferior). Em um SO de 32 bits, o baixo espaço de memória reservado para o DMA reduz a quantidade de RAM que o sistema pode endereçar, portanto, ele é normalmente minimizado.
Isso geralmente afeta apenas dispositivos que podem se beneficiar de grandes mapeamentos de hardware, como placas de vídeo. O efeito neste dispositivo particular pode ser mínimo ou zero. (Os sistemas típicos de 32 bits têm cerca de 300 MB reservados para mapeamentos de hardware ou DMA. Sistemas típicos de 64 bits têm cerca de 800 MB reservados.)