Sim, a resposta da @crate funcionou para mim.
O VLC silenciaria ou ficaria em silêncio depois de fazer uma pausa. Eu fui em ferramentas > Preferências > Áudio. Eu tive que mudar o módulo de saída para ALSA audio output
. Mas isso, por si só, não funcionou. Eu tive que alterar o dispositivo para HDA Intel
, HDMI 0
Saída de Áudio HDMI. Agora funciona muito bem. Claro, você terá que alterar o seu dispositivo para o que vai funcionar no seu equipamento. Estou executando o VLC 2.02 Duas flores no Crunchbang Waldorf X64.