Não tenho certeza se isso funciona da mesma maneira em 10.04, mas em 12.04 isso é controlado por atalhos de teclado, e você pode facilmente desativá-lo usando a GUI:
Existeumdiálogosemelhantedisponívelem10.04?(tentenomenuSistema>Preferências)
Alémdisso,comoBenapontou,mesmoquevocêevitequeoUbuntuefetueLogout/Reinicialização/Desligamento,etc,osimplesfatodeoUbuntureceberoeventoCtrl+Alt+DeldosoftwaredaVMpodeimpedirqueseusistemaoperacionalhostdeagirsobreissoquandooUbuntutemofoco.
IssosignificaquevocêpodecorrigiroproblemanoladodoUbuntu,masaindaprecisasecertificardequeesseeventonãosejacapturadopelocliente,mesmoquetenhaofoco.
NoVirtualBox,háumaopção"Auto-Capture Keyboard" que controla esse comportamento.