Se você criar um disco rígido virtual (seu espaçador de 8 GB), isso funcionará como um disco rígido. Então o aviso é completamente normal. Para o sistema operacional convidado (o ubuntu que você está tentando instalar), a máquina virtual funciona como um computador normal. E como em um computador real, ele perguntará se você deseja formatar a unidade ou não.
Conclusão: você pode formatar com segurança porque está formatando o disco rígido virtual (arquivo de disco) e não o físico real.