O instalador do Windows 7 mostrará todas as unidades e partições, independentemente do estado formatado.
Quando você estiver no Windows 7, apenas as unidades com sistemas de arquivos montáveis serão exibidas. Você precisará usar o System Management para formatar a unidade, seja NTFS ou FAT.
Tenha cuidado, ao formatar, de não selecionar a unidade / partição incorreta e perder seus dados! :)