Infelizmente, as preferências do Time Machine permitem que você defina quais unidades / pastas deseja ignorar, não as que deseja fazer backup. Você pode obter o comportamento desejado, excluindo todas as pastas das quais não deseja fazer backup, mas é um pouco trabalhoso. Eu sugiro usar SuperDuper ou algum tipo de VCS se você quiser apenas fazer o backup incremental de uma pasta.