Confira o KeePass, ele funciona no Windows e no Linux (e no Mac e muitos dispositivos móveis). Ele tem um recurso onde ele permanece minimizado e permite preencher automaticamente formulários com ele. Você acabou de abri-lo, digite sua senha mestra ou keyfile, ele descriptografa, e está pronto para ir. Se você fechá-lo, as senhas não poderão mais ser preenchidas automaticamente, o que é bom.