Eu acredito que a opção FAT usa o FAT16.
Confirmado por este link nos Fóruns de Hardware do Tom (grifo meu).
Of course it sees and can also format FAT16 partitions: I always format my flash drives, CF and SD with FAT16, because embedded systems, like cameras and mp3 players don't read FAT32 (only the very new models).
But of course you must create a partition not larger than 2GB, because that is the FAT16 physical limit. In the Format context menu you'll find the FAT32 and FAT options. FAT stands for FAT16.
Observe que, quando a postagem diz que "somente muito novos" dispositivos leem FAT32 ..., que foi postado em 2006. Independentemente disso, acredito que isso responde à sua pergunta.