Eu fugi gritando de qualquer documentação que menciona o Lilo como um bootloader que você pode estar usando. Neste caso, a documentação do VMWare 4 (que você está citando) tem 10 anos. Ignore isso.
Além disso, se você precisar do desempenho do banco de dados, não deseja emular nada .
Até mesmo um disco "bruto" no VMWare está passando por um controlador de disco virtual (leia-se: emulado). Isso é melhor do que passar por um controlador de disco virtual e, em seguida, VMFS e, em seguida, NTFS - mas apenas apenas.
Eu vou ser franco, suas opções são:
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Instale o MySQL no Windows. Eu não tentei por yonks, mas acredito que ainda funciona. Mesmo se você mantiver o ambiente virtualizado que interage com o banco de dados, isso seria melhor para aplicativos de IO elevados.
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Descarregue ou virtualize o Windows, torne o Ubuntu o host. Se a sua aplicação principal for baseada em Linux, abandone as janelas ou, pelo menos, chute-a para uma parte do sistema que não exija muito recursos.
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Mova o disco do banco de dados para outro controlador de disco e configure o VMWare para passar adiante. Eu não tenho certeza se você pode fazer isso com as variantes da estação de trabalho, mas "passagem" é uma boa maneira de dar às VMs acesso nativo real ao hardware. A sobrecarga é bastante mínima também, mas nem sempre funciona e requer hardware extra se você tiver apenas um barramento.
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Divida o sistema em duas (ou mais) instalações bare-metal.