No Windows 7, com o Truecrypt 6.3a e o controle de conta de usuário do Windows ativado (padrão), as permissões de segurança do volume true crypt montado são padronizadas para somente leitura para o grupo "usuários" do computador local.
Isso pressupõe que você NÃO esteja montando o volume "somente leitura" no truecrypt.
Aplicativos que não são "executados como administradores", portanto, têm acesso somente no nível do usuário e exigem que o UAC solicite e você responda para obter permissões de administrador, mesmo se você for um membro do grupo de administradores locais. Isso funciona ao criar uma pasta ou renomear um arquivo no volume montado, mas quando você abre um arquivo em um aplicativo, por exemplo, o Excel, ele vê o arquivo como somente leitura e nunca solicita que você eleve as permissões.
A solução temporária é editar os volumes de permissões do arquivo WINDOWS após a montagem e conceder a você mesmo controle total OU controle total ao grupo USERS.
Não tenho certeza se isso pode ser alterado no procedimento de montagem do Truecrypt para conceder automaticamente ao usuário logado controle total ou se houver uma solução melhor.