3.5 "HDDs são realmente muito grandes para caber dois deles na baia de drive de 5,25" (a soma dos tamanhos deve dizer isso).
Sem mencionar os problemas de calor: dois acionamentos montados tão próximos teriam sérios problemas de propagação de calor e estariam rodando a uma temperatura visivelmente maior, aumentando assim a chance de falha drasticamente.
Em suma, é uma má ideia.