Backup
Tenha pelo menos três dispositivos, incluindo seu computador. 4 é ainda melhor.
Todos eles devem estar funcionando e razoavelmente atualizados.
Eles nunca devem estar todos juntos no mesmo lugar.
Se uma dessas políticas for violada, apresse-se e conserte-a. Se eles estiverem todos no mesmo lugar, leve um deles para outro lugar o mais rápido possível. Se um deles estiver corrompido, substitua-o.
Uma solução simples é deixar um HD no trabalho.
De vez em quando você tira outro HD no seu trabalho e no mesmo dia em que você traz o que você já havia deixado lá.
Em casa, você os mantém sincronizados com o Unison.
Sem dores de cabeça. Nenhuma perda de dados. Felicidade.
Criptografia
Se você se preocupa com criptografia, leve em consideração que isso é realmente eficaz somente se você criptografar seu dispositivo antes de armazenar qualquer coisa nele. Se algo já foi escrito no passado, sobrescreva todo o dispositivo com zeros antes de reiniciar.
Se você usa Linux e gosta de GUI, eu recomendo que você o formate com o Gnome Disk Utility e simplesmente verifique a caixa de criptografia. Fácil e seguro.