Se você tiver a senha de administrador, o Windows suporta isso: link
Existem também programas do tipo sudo para Windows ( link ) que são mais flexíveis que as runas.
Eu quero executar o script perl automaticamente todos os dias no win32 com um usuário diferente do usuário conectado no momento em que alguém poderia fornecer uma ideia? ?
Você não pode executar o script a partir da "tarefa de agendamento" do Windows? Você também pode configurá-lo para ser executado com um usuário diferente.
Ou use o RJBS App :: Cronjob, que li em seu calendário de aventuras aqui: link
Não tenho certeza se isso funcionará no Windows ...