%TMP%
e %TEMP%
ambos apontam para C:\Users\username\AppData\Local\Temp
, não para C:\Windows\Temp
. Você precisa escrever o caminho completo ou colocá-lo em uma variável manualmente assim:
SET folder="C:\Windows\Temp"
...your code...
echo Error: %folder%\web.config.hints.cancer.gov does not exist!