Isso depende do que você precisa fazer backup.
Tudo o que é apenas dados, ou seja, músicas, imagens, arquivos de texto (arquivos de configuração) e filmes pode ser restaurado sem nenhum problema.
Os executáveis (qualquer coisa em /bin /sbin /usr/bin /usr/sbin e alguns outros locais) não são utilizáveis de um backup em geral. Isso não deve ser um problema, embora os programas que você instalou possam simplesmente ser instalados novamente.