Esses ícones de sobreposição são de um sistema de controle de versão. Eu acho que o seu é do SVN do Subversion.
Se você tiver certeza de que deseja remover esses ícones, poderá excluir a pasta .svn
oculta na pasta superior onde os ícones aparecem.
Outra possibilidade é desinstalar o aplicativo de subversão, por ex. "TortoiseSVN" ou algo parecido.