No momento, encontrei essa solução. Primeiro op tudo eu redefinir compiz com:
gconftool-2 --recursive-unset /apps/compiz-1
e unidade redefinida para:
unity --reset
Eu encontrei isso em www.webupd8.org. As janelas estão normais agora. Compiz é o meu gerenciador de janelas. A cor está de volta e eu posso mover as janelas.