Eu pesquisei um pouco e recebi uma resposta no fórum sublime.
Veja como eu fiz isso ...
Execute isso no console: [(v.run_command("undo"), v.run_command("save")) for v in window.views()]
. Isso desfará todas as alterações feitas em todos os arquivos abertos, em seguida, salve-o.
Se você não quiser salvar tudo, apenas [(v.run_command("undo")) for v in window.views()]
Você pode abrir o console abaixo na extrema esquerda da barra de status e colar esse código e pressionar Enter.
Espero que isso ajude alguém.