Não. A única opção seria criar vários grupos de usuários que usam diferentes servidores Lync (pools), isso não muda mesmo se você decidir atualizar para o Skype for Business. Você não pode criar grupos de contatos por padrão também. Você pode permitir que os usuários visualizem apenas "grupos" de usuários por meio de particionamento da lista de endereços global, mas contanto que os usuários estejam no mesmo pool e conheçam o endereço um do outro, eles poderão se comunicar.