Para associar uma extensão de arquivo a um programa, você cria um arquivo .desktop (vivendo em ~ / .local / share / applications) primeiro para o programa e, em seguida, especifica a associação no mimeapps.list (que também reside em ~ / .local / share / applications).
Para o caso específico:
crie o arquivo ~ / .local / share / applications / x64.desktop com o seguinte conteúdo (se o aplicativo x64 não tiver uma entrada no menu):
[Desktop Entry]
Version=1.0
Name=x64 Application
GenericName=x64 Application
Comment=Application to open prg files
Exec=/usr/bin/x64 %F
Type=Application
Terminal=true
Categories=Utility
Depois, no ~ / .config / mimeapps.list, você pode adicionar a linha:
application/x-extension-prg=x64.desktop
Para associar o aplicativo à extensão (se você conhece o tipo MIME, é possível substituir application / x-extension-prg pelo tipo MIME do arquivo.