Depende dos métodos escolhidos pela ferramenta de clonagem. Existem métodos bit-a-bit que duplicarão a unidade de maneira idêntica em todos os sentidos. Outros métodos clonarão os dados e as partições, mas gravarão os dados sequencialmente e removerão os fragmentos. A maioria das ferramentas de clonagem o guiará pelo processo e explicará o que suas opções fazem.