Seu Windows Pro ISO ainda funcionará para corrigir qualquer problema de inicialização.
Inicialize a partir do CD ou USB do Windows e clique no link "Reparar". Aqui você pode clicar em "Solucionar Problemas", "Opções Avançadas" e "Reparo de Inicialização".
Isso tentará reparar o sistema para permitir que ele seja inicializado.
Se isso não funcionar, inicie novamente e vá para "Solucionar problemas" e "Redefinir este PC". Isso basicamente colocará o Windows 10 de volta ao estoque, mas não excluirá nenhum dos seus arquivos / documentos / fotos.
Lembre-se de que, depois de fazer isso, talvez seja necessário inicializar a partir de um disco / usb do Ubuntu e reinstalar o GRUB posteriormente.
Para referência futura, não use o CC Cleaner para remover seus arquivos antigos. O Windows 10 está embutido. Botão direito do mouse em seu disco rígido em "Meu Computador" e para ir propriedades. De lá, clique no botão "Limpeza de disco". Na janela Limpeza de Disco, clique em "Limpar Arquivos do Sistema". Aqui você terá uma lista onde poderá colocar uma marca de seleção ao lado de "Instalações anteriores do Windows". Isso irá removê-los adequadamente.