1) The Samsung 850 SSD PRO series is capable of NCQ, is that feature worth the extra money over the EVO series in that configuration?
Praticamente todas as unidades têm esse recurso, incluindo o EVO. O Pro é um disco mais rápido, mas não tem nada a ver com o NCQ.
2) What do you think about this setup in general? Would it be better (in terms of performance) to only have 2x2TB 850 SSDs?
Não. Desempenho SSD tende a plateu em cerca de 256-512GB. Acima disso, SSDs maiores são limitados pela interface SATA, portanto, várias unidades serão mais rápidas.
3) Any other considerations I should do?
Se a velocidade e o desempenho são suas preocupações (em oposição ao custo), os SSDs PCIe (e por extensão, NVMe) serão muito mais rápidos.
4) Will I be able to upgrade the SSD firmware using Samsungs Magician Software? Will it effect the RAID Array?
Não. Você precisa remover as unidades da matriz para modificar o firmware.