Claro que você pode. Você só precisa selecionar o método manual partitioning e dizer ao instalador para não formatar qualquer partição que você queira usar.
No entanto, você terá que criar pelo menos uma partição ext3 / ext4 vazia onde instalar o Ubuntu (você pode escolher também criar outra partição vazia de cerca de 2Gb para ser usada como swapspace ). Você pode reparticionar seu disco rígido, por exemplo, usando o GParted ao vivo.
O Ubuntu também instalará grub2 para você, detectando sua outra instalação do Windows.
Boa sorte!