Sim, você deve poder excluir facilmente a partição existente e substituí-la por uma partição NTFS.
O problema é que o Windows não reconhece o tipo de partição na unidade sem software adicional com o qual você só gostaria de se preocupar se realmente quisesse compartilhar dados com um Mac.
É a outra direção, mas eu compro regularmente uma variedade de unidades de passaporte WD em qualquer formato disponível e barato e apenas particiono para o meu Mac.