Se você não gosta da idéia de executar o Gnome-do a partir do terminal, uma maneira de descobrir o que está acontecendo é iniciá-lo como gnome-do > ~/.dolog.txt e ler esse arquivo quando ele falhar.
O que isso desvia a saída do gnome-do (leia as informações de depuração) para o arquivo dolog.txt. Este arquivo será encontrado em seu diretório pessoal, como em /home/username/dolog.txt
Você pode registrar um bug contra o gnome-do com esse arquivo no Launchpad para ajudar a solucioná-lo.
Eu também estou tendo alguns problemas com o gnome-do crash dessa forma também, e talvez com todas as nossas entradas, os desenvolvedores poderão resolvê-los.
No que diz respeito ao seu outro problema, que é reiniciar o gnome-do uma vez que ele falha, você pode tentar essa solução alternativa que achei bastante útil: Atribua uma tecla de atalho para reiniciar o gnome-do, como Ctrl + Shift + Space, e use-a para relançá-la.
Uma maneira fácil seria lançar gconf-editor
navegue até apps- > metacity- > global_keybindings e atribua o valor <Control><Shift><Space> a run_command_1
e, em seguida, vá para apps- > metacity- > keybinding_commands e digite exec gnome-do > ~/dolog.txt como o valor do comando_1
Agora, quando o gnome-do travar, você terá uma maneira fácil de reiniciá-lo (Ctrl + Shift + Space) em vez de entrar no menu novamente ... E como esse atalho está tão próximo do atalho original para invocar o gnome-do, ele tem a vantagem adicional de ser fácil de lembrar!