Espero que a atualização para o Windows 10 tenha feito várias modificações no registro. O Windows 10 também pode usar um formato de arquivo diferente no disco que o Windows 8.1 simplesmente não entende. (A Microsoft regularmente faz alterações superficiais ou reais em formatos de arquivos internos entre versões. Compare o SQL Server, em que você não pode nem mesmo fazer um backup de uma versão mais recente e restaurá-la em uma versão mais antiga do mesmo produto.A atualização é um caminho unidirecional.)
Sobrescrevendo cegamente o HKLM em particular com uma cópia de uma versão mais recente do Windows está vinculada para causar problemas. Lembre-se de que muitos dos valores armazenados no registro não estão vinculados por qualquer contrato para ter significados particulares, e o significado de diferentes valores pode mudar mesmo com uma simples atualização, e muito menos um upgrade de sistema operacional inteiro para uma nova versão.
Apenas recrie suas conexões de dentro do PuTTY . É quase certo que será mais fácil, menos propenso a erros e menos arriscado do que tentar substituir o registro. Mesmo que você consiga importar o arquivo de registro antigo, não há como dizer que problemas estranhos podem surgir no futuro devido a valores de registro inesperados ou sem suporte.