Está acontecendo porque uma das colunas no meu gráfico de Gantt tem um título longo e eu espremi a largura da coluna para ser muito pequena. (Veja o título e largura da caixa na imagem abaixo). O diálogo Field Settings
para essa coluna tinha Header Text Wrapping
box marcada, o que estava causando o aumento da altura do cabeçalho, mesmo que o texto não estivesse visível, independentemente da altura.
Eu corrigi-o desmarcando esta caixa para todas as colunas visíveis. Nota: Eu tentei selecionar todas as colunas de uma vez e desmarcando a caixa, mas isso não demorou. Isso pode ser apenas um bug no Project.