Não, não é relevante.
Os clientes estão obtendo os arquivos através do protocolo (S) FTP, não por chamadas do sistema de arquivos para o servidor.
Portanto, contanto que o software do servidor FTP escolhido (S) possa ler o sistema de arquivos que contém os arquivos que estão sendo exibidos, os clientes se comportarão da mesma maneira, pois eles ainda estão interagindo com o servidor da mesma maneira ( via SFTP).